El SERVICIO ANTIMICROBIANOS forma parte del Dpto. Bacteriología del Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (INEI) – ANLIS “DR. CARLOS G. MALBRÁN”.
Sus principales funciones se focalizan en las áreas de: 1) Diagnóstico Referencial, 2) Vigilancia de la Resistencia a los Antimicrobianos, 3) Programas de Evaluación Externa de la Calidad, 4) Formación de Recursos Humanos y 5) Líneas de investigación.
1) Diagnóstico Referencial:
El Servicio Antimicrobianos es el “Laboratorio Nacional de Referencia en Resistencia a los Antimicrobianos” y desarrolla actividades en las áreas de:
- Diagnóstico fenotípico y molecular de mecanismos de resistencia a los antimicrobianos.
- Diseño y evaluación de métodos diagnósticos para la caracterización de mecanismos de resistencia y su aplicación en los laboratorios de microbiología clínica.
- Evaluación de mecanismos de diseminación horizontal o vertical de resistencia a los antimicrobianos.
- Vigilancia de la resistencia en patógenos hospitalarios y de la comunidad. Red WHONET-Argentina y SIREVA II-OPS/OMS (S. pneumoniae, N. meningitidis y H. influenzae).
Por otro lado, el Servicio también se desempeña como “Laboratorio Regional de Referencia en Resistencia a los Antimicrobianos-OPS/OMS “, desarrollando actividades de:
- Coordinación del “Programa Latinoamericano de Control de Calidad en Bacteriología y Resistencia a los Antimicrobianos” de OPS/OMS.
- Capacitación continua a través de Cursos regionales, Talleres, Conferencias, etc.
- Confirmación y caracterización de mecanismos de resistencia emergentes en la Región.
METODOLOGÍAS UTILIZADAS EN EL SERVICIO ANTIMICROBIANOS PARA EL DIAGNÓSTICO REFERENCIAL:
- Antibiograma por difusión
- Concentración inhibitoria mínima (CIM) por métodos de referencia (dilución en agar y en caldo), epsilométricos y automatizados
- Métodos de screening de carbapenemasas : Tritón Hodge Test, Blue-Carba test, CarbaNP Direct , mCIM/eCIM e inmunocromatografía
- Métodos para evaluación de sensibilidad a colistín: Colistín Drop Test , Colistín Agar Spot, Método de elución de discos de colistín y Método de predifusión con tabletas Rosco-Neosensitabs®
- Evaluación de sinergias y búsqueda de alternativas terapéuticas por técnicas de difusión en agar o microdilución en caldo
- MALDI-TOF
- Curva de muerte
- Ensayos con inhibidores de bombas de eflujo
- Análisis Poblacionales (PAP)
- Métodos microbiológicos de medida de actividad enzimática
- Conjugación biparental y electrotransformación
- PCR de punto final simplex y multiplex
- PCR real time simple y multiplex
- PFGE (Electroforesis en Campo Pulsado)
- MLST (Multi Locus Sequence Typing)
- Secuenciación de ácidos nucleicos por tecnología de primera generación (Sanger)
- Secuenciación de genoma completo con tecnologías de segunda y tercera generación (Illumina y ONT)
- Análisis bioinformático de secuencias de ácidos nucleicos y proteínas
- Clonado
- Southern-blot
- Perfil plasmídico por Endonucleasa-S1
- RFLP (polimorfismos de restricción) de plásmidos
- Replicon typing: tipificación de plásmidos por PCR
- Estudio de plataformas genéticas por PCR
2) Vigilancia de la Resistencia a los Antimicrobianos:
Una de las funciones del Servicio Antimicrobianos es la de llevar a cabo la vigilancia laboratorial de la resistencia a los antimicrobianos en bacterias aisladas de infecciones jerarquizadas clínicamente. Esta tarea se realiza a través de la Red Nacional de Vigilancia de la Resistencia a los Antimicrobianos, WHONET-Argentina y la Red SIREVA II (Sistema de Redes de Vigilancia de los Agentes Bacterianos Responsables de Neumonía y Meningitis).
La Red WHONET fue creada en 1986 para proveer información sobre los perfiles de resistencia a los antimicrobianos de patógenos hospitalarios y de la comunidad que contribuya al desarrollo de estrategias locales, regionales y nacionales para el uso racional de antimicrobianos y el control de la resistencia. Para esto, se prioriza la capacitación de los laboratorios en el diagnóstico microbiológico y de la RAM y jerarquizar su rol en los Programas de Control de Infecciones y de uso adecuado de los antimicrobianos.
En la actualidad la Red WHONET-Argentina está compuesta por 93 laboratorios clínicos distribuidos en las 24 jurisdicciones del país que aportan datos de los perfiles de sensibilidad a los antimicrobianos de aprox. 150.000 bacterias/año. Los laboratorios realizan las pruebas de sensibilidad siguiendo protocolos estandarizados en el marco de un estricto control de calidad interno y externo. Los datos de sensibilidad a los antimicrobianos son recopilados y analizados mediante el software WHONET 5.6 (OMS). Los análisis son publicados en forma de estadísticas semestrales, tendencias en el tiempo, mapas de distribución de mecanismos de resistencia críticos por región geográfica y publicaciones a congresos. (http://antimicrobianos.com.ar/category/analisis-de-ram/ ).
Los resultados de la vigilancia de Red WHONET-Argentina contribuyen a la Red de Vigilancia Regional de la Resistencia a los Antimicrobianos RELAVRA+ (OPS) y al “Sistema Mundial de Vigilancia de la Resistencia a los Antimicrobianos” GLASS-OMS. (Informes anuales de RAM)
La Red SIREVA II – Argentina, se conformó en 1993 en colaboración con el Servicio de Bacteriología Clínica en el marco del Programa Regional SIREVA I y II, con el fin de proveer información epidemiológica sobre la distribución de serotipos/serogrupos y sensibilidad a los antimicrobianos en aislamientos invasivos de S. pneumoniae, H. influenzae y N. meningitidis. La información obtenida de esta Red contribuye en la evaluación de la cobertura de vacunas y en la elección de la terapia antimicrobiana más apropiada.
3) Programas de Evaluación Externa de la Calidad:
El Laboratorio tiene a cargo la Dirección del “Programa Nacional de Control de Calidad en Bacteriología” en el cual participan 464 laboratorios del país.
Este Programa de evaluación externa de la calidad inicio en el año 1990. Actualmente distribuye una encuesta anual con 4 aislamientos bacterianos incógnita y se desafía a los laboratorios en la identificación bioquímica de las especies bacterianas, detección de mecanismos de resistencia de impacto clínico e informe de las pruebas de sensibilidad a los antimicrobianos. Adicionalmente, cada año se entregan aislamientos bacterianos de referencia para el control de calidad de las pruebas de sensibilidad. Los laboratorios participantes del Programa tienen acceso a normativas actualizadas para la realización e interpretación de las pruebas de sensibilidad, manuales y guías de procedimientos en bacteriología y bibliografía internacional de soporte.
El Servicio es responsable de la Coordinación del “Programa Latinoamericano de Control de Calidad en Bacteriología y Resistencia a los Antimicrobianos” de OPS/OMS que se inicio en el año 2000, en el cual participan los Laboratorios Nacionales de Referencia de 17 países de la Región: Bolivia, Chile, Colombia, Costa Rica, Ecuador, El Salvador, Guatemala, Honduras, Cuba, México, Nicaragua, Panamá, Paraguay, Perú, República Dominicana, Uruguay y Venezuela. Se envía una encuesta anual con 10 aislamientos bacterianos incógnita y se desafía a los laboratorios en la identificación bioquímica de las especies bacterianas, detección de mecanismos de resistencia, informe de las pruebas de sensibilidad a los antimicrobianos y detección molecular de genes de resistencia de impacto clínico. Adicionalmente, cada año se envían7 aislamientos bacterianos de referencia para el control de calidad de las pruebas de sensibilidad. Los laboratorios participantes del Programa tienen acceso a normativas actualizadas para la realización e interpretación de las pruebas de sensibilidad, manuales y guías de procedimientos en bacteriología y bibliografía internacional de soporte.
En el año 2018 se inicia el «Caribbean External Quality Assurance Program in Bacteriology and Antimicrobial Resistance» en el cual participan los Laboratorios Nacionales de Referencia de la región : Belize, Barbabos, Suriname , Haiti, Guyana, Trinidad & Tobago, Jamaica, The Bahamas, Antigua and Barbuda, Dominica , Grenada, Saint Lucia, Saint Kitts and Nevis y Saint Vincent and the Granadines.
Por otra parte, el Servicio participa en los siguientes Programas de Evaluación Externa de la Calidad:
- UK NEQAS. United Kingdom National External Quality Assessment Schemes. Agentes bacterianos responsables de meningitis y neumonías. Coordinado por University Hospitals Birmingham.
4) Formación de Recursos Humanos:
CURSOS:
Cada año el Laboratorio dicta el Curso Intensivo de Actualización en Antimicrobianos “Dra. Alicia Rossi”.
CAPACITACIÓN DE PROFESIONALES:
En el Laboratorio se realiza la capacitación en técnicas fenotípicas y moleculares de diagnóstico y caracterización de mecanismos de resistencia a los antimicrobianos. Esta capacitación está dirigida a profesionales de la salud procedentes de laboratorios de referencia, hospitales y universidades tanto nacionales como extranjeras. Ver requisitos y condiciones para esta actividad en: http://antimicrobianos.com.ar/pasantias-y-rotaciones/
5) Líneas de Investigación:
Diseño y evaluación de métodos fenotípicos y moleculares para el diagnóstico de mecanismos de resistencia a drogas de impacto clínico.
- Evaluación de actividad in vitro de nuevas drogas o combinaciones para el tratamiento de gérmenes multirresistentes.
- Caracterización de ß-lactamasas de espectro extendido y carbapenemasas en aislamientos clínicos de Enterobacterales y bacilos Gram negativos no fermentadores.
- Caracterización de mecanismos plasmídicos de resistencia a colistín en aislamientos de bacilos Gram-negativos.
- Caracterización fenotípica, molecular y genómica de mecanismos de resistencia emergentes y asociaciones con hipervirulencia.
- Proyectos interdisciplinarios de estudios fenotípicos, moleculares y genómicos de mecanismos de resistencia bajo el enfoque de Una Salud.
- Vigilancia genómica de aislamientos clínicos multirresistentes, con resistencia extendida o panresistentes.